Model: Nextseq 550
Hãng sản xuất: Illumina/Mỹ
– Là hệ thống giải trình tự duy nhất đồng thời có khả năng triển khai ứng dụng chạy giải trình tự và đọc chip sinh học microarray
– Hệ thống giải trình tự ADN thế hệ mới sử dụng công nghệ đọc trình tự theo nguyên lý tổng hợp: Sequencing by Synthesis – SBS
– Toàn bộ quá trình đọc trình tự gen được tiến hành trên các bề mặt các flow cell, tiện lợi sử dụng và dễ dàng thao tác

Danh mục :

– Là hệ máy giải trình tự công suất cao có khả năng giải trình tự toàn bộ 01 hệ gen người (với độ sâu dữ liệu 30X) trong 1 lần chạy.

– Giải trình tự lên tới 16 hệ exome, 20 hệ transcriptome40 hệ biểu hiện gen trong 1 lần chạy.

– Giải trình tự lên tới 15 mẫu sàng lọc thai nhi trước sinh không xâm lấn (Non-invasive prenatal testing NIPT).

– Công suất đọc giải mã trình tự gen: 16-120 Gb trong 1 lần chạy, phù hợp cho nhiều ứng dung.

– Số lượng đoạn đọc sau khi lọc đạt tới 130 – 800 triệu đoạn trong 1 lần chạy.

Kit công suất cao cho NextSeq 550 Kit công suất vừa cho NextSeq 550
Độ dài đọc Thời gian chạy Đầu ra Độ dài đọc Thời gian chạy Đầu ra
2 x 150 bp 29 giờ 100 – 120 Gb 2 x 150 bp 26 giờ 32.5 – 39 Gb
2 x 75 bp 18 giờ 50 – 60 Gb 2 x 75 bp 15 giờ 16.25 – 19.5 Gb
1 x 75 bp 11 giờ 25 – 30 Gb      

 

Độ dài đọc Kit công suất cao cho NextSeq 550 Kit công suất vừa cho NextSeq 550
2 x 150 bp > 75% dữ liệu đạt Q30* > 75% dữ liệu đạt Q30*
2 x 75 bp > 80% dữ liệu đạt Q30 > 80% dữ liệu đạt Q30
1 x 75 bp > 80% dữ liệu đạt Q30  

*Chất lượng dữ liệu Q30 tương đương với độ chính xác 99.9%

– Quy trình giải trình tự hoàn toàn tự động, tích hợp phần mềm điều khiển thông minh:

  • Các quy trình giải trình tự thông thường từ tách mẫu tới phân tích kết quả trong vòng 30 tiếng
  • Đặc biệt với quy trình sàng lọc NIPT, giải trình tự ADN tách từ máu mẹ phân tích và cho kết quả trong vòng 24 tiếng

Ngoài ra, hệ thống NextSeq 550 có tích hợp tính năng đọc chip sinh học microarray:

1. Infinium Human CytoSNP-12 BeadChip: Nghiên cứu di truyền học tế bào, di truyền học quần thể, phân loại dòng giống dựa trên công nghệ SNP. Mỗi BeadChip được quét trong 40 phút, quét mỗi mẫu mất 3.3 phút.

2. Infinium CytoSNP-850k BeadChip: Nghiên cứu di truyền học tế bào, di truyền học quần thể, phân loại dòng giống với độ phân giải cao. Mỗi BeadChip được quét trong 40 phút, quét mỗi mẫu mất 5 phút

3. Infinium HumanKaryomap-12 BeadChip: Chẩn đoán bệnh di truyền phôi (PGD) khi thực hiện biện pháp hỗ trợ sinh sản (Invitro fertilization – IVF). Mỗi BeadChip được quét trong 40 phút, quét mỗi mẫu mất 3.3 phút.

Thông tin chi tiết: https://www.illumina.com/systems/sequencing-platforms/nextseq/specifications.html

– Phát hiện các bệnh di truyền tế bào, phục vụ cho chẩn đoán trước sinh, sử dụng công nghệ Beadchip array
– Sàng lọc bất thường về số lượng nhiễm sắc thể của nhiễm sắc thể 13, 18, 21 , X, Y với các thai từ 10 tuần tuổi đối với các trường hợp mang thai tự nhiên, 8 tuần tuổi với trường hợp mang thai nhờ thụ tinh nhân tạo (In vitro Fertilization)
– Giải trình tự toàn bộ hệ gen người, toàn bộ hệ gene nhỏ, toàn bộ hệ exome, transcriptome, nghiên cứu biểu hiện gen
– Giải trình tự các gene đích (Targeted sequencing). Có khả năng phát hiện rõ ràng đột biến, phục vụ trong chẩn đoán ung thư và điều trị đích
– Giải trình tự 16S ARN ứng dụng trong phân tích Metagenomics, phân tích môi trường, xác định tác nhân vi khuẩn gây bệnh
– Giải trình tự mARN;  small ARN trong nghiên cứu

Thông tin khác

Supplier